Le tableau ci-dessous est une liste partielle des plateformes de logiciels de recherche au Canada que CANARIE soutenait auparavant dans le cadre de son mandat en tant que bailleur de fonds des logiciels de recherche et que nous considérons comme activement prises en charge ou en cours de développement. Selon l’Évaluation de l’état actuel des logiciels de recherche, il y a deux catégories de LR : 1) les outils de LR; 2) les PLR ou services de LR (aussi appelés laboratoires scientifiques virtuels, environnements de recherche virtuels ou passerelles scientifiques). Bien que le contenu du tableau ne se rapporte qu’aux PLR, vous pouvez accéder à la plupart des services de LR en cliquant sur le lien des PLR. En collaboration avec ses partenaires, l’Alliance s’emploie à créer un répertoire exhaustif des services et plateformes de logiciels de recherche au Canada, et cette liste constitue le point de départ de cet effort.
L’Alliance a également recours aux services du Research Software Directory (RSD) pour promouvoir la visibilité, l’incidence et la réutilisation des logiciels de recherche canadiens. La liste des logiciels de recherche canadiens ci-dessous est également disponible dans le RSD.
Mis au point par le Netherlands eScience Center, le RSD est un répertoire international des ressources et outils logiciels qui sont utilisés dans le contexte de la recherche universitaire. Il fournit un accès à un large éventail de ressources et d’outils logiciels.
Si vous avez un projet actif concernant des logiciels de recherche dont vous aimeriez voir les détails ajoutés dans la liste, ou si vous souhaitez modifier les renseignements que contient le tableau, veuillez envoyer un courriel à rs-lr@alliancecan.ca.
Exigences :
- Est un logiciel de recherche canadien (c.-à-d. est détenu ou dirigé par un établissement canadien).
- Est une plateforme/passerelle scientifique, ou une composante d’un logiciel pouvant être déployé de façon indépendante.
- Est disponible en vertu d’une licence d’exploitation libre ou découle d’un projet en exploitation libre financé par des fonds publics.
- Est exploité actuellement.
- Cadre avec le mandat de l’Alliance en matière de promotion.
Une plateforme de recherche qui ne répond pas à l’une des exigences ne pourrait pas être ajoutée dans le RSD.
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Nom |
Mots-clés |
Titulaires |
Courriel de la personne-ressource |
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médecine nucléaire, microscopie, IRM, visualisation, 3D, traitement informatisé d’images médicales, rendu volumétrique |
Harvard Brigham and Women’s Hospital, Boston, MA; Université Queen’s, Kingston (Ontario); autres |
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Plateforme de modélisation du flux sanguin par CHP PM3 : SimVascular (Site Web/Source/Article) |
modélisation, informatisation d’images médicales, mécanique des fluides, cardiovasculaire |
Institut de recherche en santé Lawson, London (Ontario) |
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ArcticConnect – Plateforme aux fins de la recherche sur l’Arctique et le partage de renseignements (Site Web/Source) |
arctique, polaire |
Cybera et Université de Calgary |
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atlas, cartographie en ligne, histoire orale, géovisualisation, multimédia, cartographie de récits |
Université Concordia et Université Carleton |
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| Abinit (Site Web / Source) | Université Dalhousie, Université de Montréal, Université du Québec à Trois-Rivières | ||
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génomique, transcriptomique, séquençage, analyse de séquence, BLAST, biologie computationnelle |
Brian Fristensky, Université du Manitoba |
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Collaboratoire scientifique des écrits du Canada – CSÉC (Site Web/Source) |
culture canadienne et histoire, sciences humaines numériques, français, études culturelles |
Université de l’Alberta et Université de Guelph |
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CHORD de CanDIG : répertoire des données omiques sur la santé réparties au Canada (Site Web/Source) |
génomique, CanDIG, GA4GH |
Université McGill |
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Canadian Advanced Network for Astronomical Research (CANFAR) – Réseau de pointe canadien pour la recherche en astronomie (Site Web / Source) |
authentifié, CANFAR, Condor, répartis, traitement, récupération, stockage, machine virtuelle, service Web |
Université de Victoria |
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grappe, modélisation de données, supercalculateur, CBRAIN, visualisation, neurologie, tâche, transfert de données |
Université McGill |
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dft conceptuelle, analyse démographique, atomes dans les molécules, théorie de l’orbitale moléculaire, matrices de densité, densité d’énergie cinétique |
Université Queen’s, Université McMaster, Université de Gand |
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ClinDIG (Source) |
génomique, santé, clinique, fédéré |
The Hospital for Sick Children, Université McGill, Canada’s Michael Smith Genome Sciences Centre, Réseau universitaire de santé |
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liaison d’entités nommées, reconnaissance d’entités nommées, sur le Web, TEI, DOL, éditeur XML |
Université de Guelph |
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DataStream (Site Web) |
qualité de l’eau, bassins versants |
The Gordon Foundation |
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Plateforme d’analyse génétique et génomique (GenAP) (Site Web/Source) |
métabolomique, biologie moléculaire, génomique, génétique, biologie, médecine, monocellulaire, santé, biologie computationnelle |
Université de Sherbrooke et Université McGill |
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Geodisy – Dépôt fédéré de découverte des données géospatiales du Canada (Site Web/Source/Article) |
métadonnées, données de recherche géospatial |
Université de la Colombie-Britannique |
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structure électronique théorique, chimie quantique |
Université McMaster |
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cancer, génome, patients, données cliniques, oncologie |
Institut ontarien de recherche sur le cancer (IORC) |
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iEnvironment (Site Web) |
morphologie fluviale, dépôt de données environnementales, cours d’eau douce, macro-invertébrés benthiques, Protocole d’évaluation des rivières de l’Ontario (PERO), eaux d’amont, eaux vives, stabilité fluviale, relevés sur les poissons, débit d’eau, cours d’eau franchissables à gué |
Université de Waterloo |
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iReceptor, immunologie, immunogénomique |
Université Simon-Fraser |
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génomique, maladie infectieuse |
Université Simon-Fraser |
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base de données, neuroscience, science ouverte, neuroinformatique, neuroimagerie, source ouverte |
McGill Centre for Integrative Neuroscience, Alan Evans lab |
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spectrométrie de masse, protéines |
Université de Calgary |
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Mass Spec Studio pour la protéomique clinique (Site Web) |
spectrométrie de masse, protéines, protéomique |
Université de Toronto et Université de Calgary |
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MINTED (Site Web) |
océans, océanographie, identifiants pérennes |
Ocean Networks Canada |
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Système de surveillance faunique Motus (Site Web/Source/Article) |
science de la conservation, écologie du mouvement, surveillance faunique |
Oiseaux Canada |
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MSS-IMProv (Site Web) |
modélisation, spectrométrie de masse, protéines |
Université de Calgary |
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science de la conservation, observation des oiseaux, données ouvertes |
Oiseaux Canada |
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collecte de données, base de données, visualisation, cartographie, mappage, javascript, Web, communication narrative, atlas |
Université Carleton |
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épidémiologie, authentification |
Institut de recherche du Centre universitaire de santé McGill (IR-CUSM) |
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épidémiologie, dépôts de données |
Institut de recherche du Centre universitaire de santé McGill (IR-CUSM) |
info@obiba.org | |
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épidémiologie, dépôts de données |
Institut de recherche du Centre universitaire de santé McGill (IR-CUSM) |
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protéomique, spectrométrie de masse, métabolomique, C++ |
Hannes Rost et équipe de OpenMS |
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modélisation du réseau de pores |
Université de Waterloo |
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stockage infonuagique, génomique, portail de recherche, métadonnées, authentification |
Institut ontarien de recherche sur le cancer |
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PACTE – Plateforme d’annotation collaborative de textes électroniques (Site Web) |
corpus, lexique, consignation, désambiguïsation, annotation textuelle, traitement du langage naturel, collaboration, entité nommée |
CRIM |
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phénotype, interface de programmation, maladie rare, phénotypage profond, données sur les malades, ontologie, jumelage, généalogie, génogramme |
The Hospital for Sick Children, Université de Toronto et PhenoTips |
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tomographie, analyse d’image, milieux poreux |
Porous Materials Engineering and Analysis Lab |
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GDR, métadonnées |
Université de la Saskatchewan |
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Adoption d’une approche de recherche fondée sur le cycle de vie au moyen d’Islandora (Site Web/Source) |
gestion de l’information, stockage de données, métadonnées |
Université de l’Île-du-Prince-Édouard |
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| Portail de recherche axé sur la découverte sécurisée des données, l’accès aux données et la collaboration (Site Web) | demandes d’accès aux données, collaboration, portail, gestion de l’utilisation, gestion des programmes, partage de données | Institut canadien du cerveau et Indoc Research | mjavadi@indocresearch.org |
| Umple (Site Web/Source/Article) | génération de code, modélisation logicielle, UML, appareils étatiques | Université d’Ottawa | umple-help@googlegroups.com |
| Produits de données en océanographie définis par l’utilisateur (Site Web) | océans, océanographie | Ocean Networks Canada | info@oceannetworks.ca |
| Passerelle de santé virtuelle (Site Web) | mobilisation des malades, gestion des données, plateforme de recherche, données, produits portables, partage de données, portail | Indoc Research | sshahnazari@indocresearch.org |
| VirusSeq (Site Web / Source) | données, virus, santé, portail de données, données ouvertes | Institut ontarien de recherche sur le cancer (IORC) | info@virusseq-dataportal.ca |
| Web-enabled Awareness Research Network – WARN (Site Web) | océans, tsunami, séisme | Ocean Networks Canada | info@oceannetworks.ca |